El Programa per al col·lectiu gai, lesbià i transsexual va ser creat per acord de Govern  el 28 de juny de 2005, coincidint amb la celebració del dia de l'alliberament gai, lesbià i transsexual. El departament depèn de la Secretaria de Coordinació Interdepartamental adscrita al Departament de la Presidència.

Aquesta és la primera vegada que la Generalitat de Catalunya contempla en el seu Pla de Govern polítiques específiques per a homosexuals i transsexuals. Aquest canvi de rumb ve donat per la necessitat d'actuar a nivell polític per afavorir la cohesió social d'aquests persones. 

El principal objectiu del Programa és treballar per a la no discriminació de les persones gais, lesbianes i homes i dones transsexuals, i evitar totes les actuacions, regulacions i actituds de discriminació que puguin donar-se en aquest sentit. Per aquest motiu, el Programa està treballant a partir d'un  Pla interdepartamental , aprovat pel Govern el 22 d'agost de 2006, que estableix les línies mestres d'actuació en els següents àmbits: 

• Legislatiu i jurídic
• Laboral
• Salut
• Educatiu
• Cultural
• Comunicació
• Benestar
• Participació i solidaritat         

• La igualtat , entenent que la base jurídica que regula la vida i les relacions de tota la ciutadania no pot fer cap tipus de diferència per motius de sentiments, d'afectes ni de sexualitats.   
  
• La llibertat , considerant que l'expressió individual i col·lectiva en les seves diverses manifestacions quotidianes, culturals, mediàtiques, educatives i de lleure han d'estar lliures de qualsevol tret d'homofòbia, lesbofòbia i transfòbia.   
  
• El benestar de totes les persones, amb independència dels seus trets personals, sentiments, afectes, sexualitats, edats i gèneres, que han de poder gaudir del conjunt dels serveis bàsics.