El transport dels RS haurà d'atendre a criteris de responsabilitat, agilitat, rapidesa, asèpsia, innocuïtat i seguretat.

Els residus recollits en les diferents zones del centre es transportaran al magatzem central de RS del mateix centre. El personal que transporta els residus haurà de portar guants que seguin resistents a les punxades i que no es puguin perforar. i que seguin resistents a les punxades.

Els contenidors i els sistemes de transport que hagin contingut residus de risc, es desinfectaran després de cada operació.

Es delimitaran i es definiran zones intermèdies d'emmagatzematge dels residus, convenientment senyalitzades, on es depositaran en espera de la recollida i trasllat cap al magatzem central.

Els RS procedents de centres hospitalaris es podran emmagatzemar dins el mateix centre sanitari durant un període màxim de 72 hores, prorrogable a una setmana si el magatzem disposa de sistema de refrigeració adequat.

Els RS procedents de centres no hospitalaris es podran emmagatzemar dins el mateix centre en funció del volum de producció i de les característiques del residu, durant un període màxim d'un mes.

El lloc d'emmagatzematge serà ventilat, espaiós, ben il.luminat, degudament senyalitzat y estarà condicionat per tal de poder-hi realitzar la seva desinfecció i neteja corresponent.

El magatzem s'haurà de poder tancar, haurà de tenir fàcil accés des de l'exterior i haurà d'estar protegit de la intemperie, de les temperatures elevades i dels animals.